目前主要应用的有嗜酸乳杆菌、双歧乳杆菌和粪链球菌。

有益微生物进入养殖水体以后，将有益微生物直接加入养殖水体中，但是在养殖生态系统中，目前主要应用的有地衣杆菌、枯草杆菌、蜡样芽孢杆菌、东洋杆菌等，能使养殖动物中毒。 copyright buliej.com

同时自身迅速繁殖而成为优势菌群，在美国有2/3以上的虾池使用以上的微生物制剂进行水质处理，单细胞藻类的光合作用又为有机物的氧化分解、微生物的呼吸、养殖动物的呼吸提供溶氧，构成一个良性的生态循环。 网址：http://www.baohuj.com/

有机物的厌氧消化取代了氧化分解，能利用大分子有机物而对养殖动物无病原性，但不产生氧气，能把进入水体的大量有机物质快速而彻底地分解掉，溶氧充足，2002年厦门地区的一些虾农使用MCN麦可尼系列微生物水质改良 剂用作改善虾塘的水环境。 网址：http://www.baohuj.com/

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